אם אני מעדכנת גרסה באייפון האנשי קשר וההודעות נמחקים מהפלאפון?

בעיקרון לא
אבל יש מקרים שהאייפון מוחק הכול בטעות אבל זה לא סביר

לא.
רצוי לעשות גיבוי בicloud או במחשב.