תשובה אחת
עד כמה שידוע לי, בכלליות אין בעיה.
אבל אם יש לך כונן אופטי (cd/dvd) אתה בבעיה, הדיסקים והכונן עלולים להידפק מזה.

אגב, יש מחשבים שבנויים מלכתחילה בצורה כזו שוכבת - שם הכונן במצב מאוזן דווקא כשהמחשב שוכב.

בהצלחה!